1) Во-первых, данные версии отличаются ценой, базовая версия стоит дешевле.
2) У базовой версии электронный ключ, в отличии от ПРОФ версии у которой ключ аппаратный. Данный электронный ключ можно устанавливать на компьютеры с разным оборудованием 3 раза, если данный лимит исчерпан, то нужно либо покупать заново проф версию 1С, или апргейдить базовую до ПРОФ (к стати данную процедуру, вы можете сделать в любой момент, нужно всего лишь заплатить разницу). Т.е. если Вы купили новый компьютер, и намерены работать на нем безгранично долго, то можете смело брать базовую версию. На одном компьютере базовую 1С можно устанавливать неограниченное количество раз. Проф версию Вы можете перемещать с компьютера на компьютер без всяких ограничений